秦王朝建立的這套中央集權機構的政權機構，以后一直被歷代王朝所仿效。其中漢代的“三公九卿”，基本上是照搬秦制。

　　秦之中央最高統治者是皇帝，皇帝以下，中央最重要的官職是「三公」，即丞相、太尉、御史大夫，合稱「三公」。

　　【丞相】：戰國時秦國原有相、相國，統一全國后，稱作丞相，李斯為第一位丞相，乃百官之首。「金印紫綬，掌丞天子，助理萬機。」

　　【太尉】：原稱尉、國尉，統一全國后稱太尉，「金印紫綬」掌武事，「主五兵」乃武官之長。

　　【御史大夫】：秦國原有御史，后置御史大夫「以貳于相」。御史大夫掌監察，「銀印青綬，掌副丞相」，其位略次于丞相。

　　在「三公」之下，有所謂「九卿」，而實際之數并不止九個，大部分為秦原有，少數是統一后新設的：

　　【奉常】：掌宗廟禮儀，有丞。

　　【郎中令】：負責皇帝的保衛和傳達，下屬有大夫、郎中、謁者。

　　【衛尉】：掌皇宮的警衛部隊，有丞。

　　【太仆】：掌皇室東馬。

　　【廷尉】：掌刑罰，全國最高司法官，有正、左、右監。

　　【典客】：主管秦王朝統治下的少數民族。

　　【宗正】：掌宗室親屬事務，有兩丞。

　　【治粟內史】：掌谷貨，有兩丞。

　　【少府】：負責供應皇室用之山海池澤之稅，有六丞。

　　【】：負責京師保衛，有兩丞。

　　【主爵】：掌列侯。

　　秦始皇統治時期，中央集權的重要特點是軍政大權獨攬于皇帝一人手中。為使大權不致旁落，使丞相、太尉、御史大夫分掌政、軍和監察大權，互不統屬。如丞相總領朝廷集議和上奏，協助皇帝處理日常事務，并收閱各地的「上計」。

　　但統兵之權卻屬于太尉，而且御史大夫也有權復查大臣的上奏和地方的「上計」。太尉雖名為最高軍事長官，但實際只有帶兵權，而無調兵權。由于三公互不統屬，所以最后決斷只能歸皇帝一人。